Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TSFMP43897 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TSFMP43897 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TSFMP43897 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms