Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLD1P28340 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLD1P28340 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLD1P28340 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
POLD1P28340 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLD1P28340 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLD1P28340 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms