Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL20Q9Y2M5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms