Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms