Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CFDP1Q9UEE9 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFDP1Q9UEE9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms