Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PARD6AQ9NPB6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PARD6AQ9NPB6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms