Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXNL1Q96CM4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms