Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATG4DQ86TL0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms