Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TSSK4Q6SA08 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms