Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Q5VSD8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q5VSD8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q5VSD8 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms