Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNAPC1Q16533 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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