Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CFHR1Q03591 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms