Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HSF1Q00613 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms