Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC12A2P55011 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC12A2P55011 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms