Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPAP53621 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPAP53621 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COPAP53621 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms