Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SMARCA4P51532 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SMARCA4P51532 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms