Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACVR1BP36896 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms