Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD13P35453 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms