Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOXA7P31268 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms