Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CMPK1P30085 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms