Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTX3P26022 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PTX3P26022 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PTX3P26022 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms