Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLR2AP24928 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms