Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MYF6P23409 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MYF6P23409 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYF6P23409 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYF6P23409 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYF6P23409 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYF6P23409 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYF6P23409 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MYF6P23409 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYF6P23409 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYF6P23409 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYF6P23409 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYF6P23409 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYF6P23409 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYF6P23409 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYF6P23409 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYF6P23409 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MYF6P23409 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYF6P23409 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYF6P23409 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYF6P23409 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYF6P23409 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYF6P23409 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYF6P23409 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MYF6P23409 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms