Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRTO14522 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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