Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFT172Q9UG01 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFT172Q9UG01 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms