Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MEPEQ9NQ76 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms