Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Capn9Q9D805 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms