Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAPERQ9BY12 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCAPERQ9BY12 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms