Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1QTNF3Q9BXJ4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1QTNF3Q9BXJ4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1QTNF3Q9BXJ4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3Q9BXJ4 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms