Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms