Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCBE1Q6UXH8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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