Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms