Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms