Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LETM2Q2VYF4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms