Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM25Q14258 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms