Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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PMS2P11Q13670 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PMS2P11Q13670 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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