Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPARDQ03181 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms