Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RPS29P62273 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
RPS29P62273 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RPS29P62273 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RPS29P62273 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RPS29P62273 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RPS29P62273 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RPS29P62273 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RPS29P62273 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RPS29P62273 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RPS29P62273 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RPS29P62273 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RPS29P62273 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RPS29P62273 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RPS29P62273 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RPS29P62273 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RPS29P62273 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RPS29P62273 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RPS29P62273 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
RPS29P62273 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RPS29P62273 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RPS29P62273 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
RPS29P62273 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
RPS29P62273 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
RPS29P62273 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
RPS29P62273 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RPS29P62273 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
RPS29P62273 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
RPS29P62273 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms