Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN17P56750 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN17P56750 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms