Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLTCL1P53675 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLTCL1P53675 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms