Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCNQ1P51787 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms