Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJA4P35212 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GJA4P35212 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GJA4P35212 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GJA4P35212 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GJA4P35212 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms