Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTPRDP23468 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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