Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms