Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CXCL2P19875 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms