Protein–RNA interactions for Protein: P15169

CPN1, Carboxypeptidase N catalytic chain, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPN1P15169 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPN1P15169 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPN1P15169 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPN1P15169 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPN1P15169 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPN1P15169 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPN1P15169 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPN1P15169 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPN1P15169 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPN1P15169 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPN1P15169 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPN1P15169 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPN1P15169 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPN1P15169 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPN1P15169 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CPN1P15169 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CPN1P15169 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CPN1P15169 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CPN1P15169 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CPN1P15169 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CPN1P15169 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CPN1P15169 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms