Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms