Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF8Q9UPP1 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms