Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5BQ9UGL1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms