Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLRP1Q9C000 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms